Protein–RNA interactions for Protein: Q96IP4

FAM46A, Putative nucleotidyltransferase FAM46A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46AQ96IP4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FAM46AQ96IP4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms