Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MS4A3Q96HJ5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC092809.4-201ENST00000420350 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 REC114-201ENST00000331090 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MS4A3Q96HJ5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms