Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
LINC00526Q96FQ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms