Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RRP36Q96EU6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRP36Q96EU6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms