Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RSPRY1Q96DX4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RSPRY1Q96DX4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms