Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NSUN4Q96CB9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSUN4Q96CB9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms