Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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FAM3DQ96BQ1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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FAM3DQ96BQ1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
FAM3DQ96BQ1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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FAM3DQ96BQ1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FAM3DQ96BQ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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