Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFT1Q96AA3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RFT1Q96AA3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms