Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX21Q969T3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX21Q969T3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms