Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMARCE1Q969G3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMARCE1Q969G3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms