Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSR2Q969E8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSR2Q969E8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms