Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRUQ92729 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRUQ92729 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms