Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGGTAQ92696 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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RABGGTAQ92696 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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RABGGTAQ92696 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
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RABGGTAQ92696 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGGTAQ92696 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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