Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA4

GTF3C2, General transcription factor 3C polypeptide 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2Q8WUA4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF3C2Q8WUA4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF3C2Q8WUA4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms