Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHDC4Q8TBB5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHDC4Q8TBB5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms