Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SPC24Q8NBT2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms