Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF38AQ8NAV1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF38AQ8NAV1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms