Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNBD1Q8NA66 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms