Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ZIC4Q8N9L1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZIC4Q8N9L1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms