Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC155Q8N6L0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC155Q8N6L0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms