Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC83Q8IWF9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC83Q8IWF9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms