Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC103Q8IW40 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC103Q8IW40 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms