Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT5

KSR1, Kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KSR1Q8IVT5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KSR1Q8IVT5 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms