Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SKAP1Q86WV1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SKAP1Q86WV1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms