Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KCNMB4Q86W47 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KCNMB4Q86W47 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms