Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBBP6Q7Z6E9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RBBP6Q7Z6E9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms