Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z443

PKD1L3, Polycystic kidney disease protein 1-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1L3Q7Z443 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PKD1L3Q7Z443 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PKD1L3Q7Z443 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms