Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHST3Q7LGC8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHST3Q7LGC8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms