Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
HECW1Q76N89 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
HECW1Q76N89 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HECW1Q76N89 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms