Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRCAPQ6ZRS2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SRCAPQ6ZRS2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SRCAPQ6ZRS2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms