Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GBP6Q6ZN66 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms