Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM72Q6ZMU5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM72Q6ZMU5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms