Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLC4A10Q6U841 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms