Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHC4Q6S5L8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms