Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOA5Q6Q788 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms