Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
EFCAB12Q6NXP0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EFCAB12Q6NXP0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms