Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NANOGP8Q6NSW7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NANOGP8Q6NSW7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms