Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG9BQ674R7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG9BQ674R7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms