Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USPL1Q5W0Q7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USPL1Q5W0Q7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USPL1Q5W0Q7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms