Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BEND3Q5T5X7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
BEND3Q5T5X7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms