Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
COL5A1-AS1Q5SY13 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms