Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PHYHD1Q5SRE7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms