Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC27A3Q5K4L6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC27A3Q5K4L6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms