Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMPD3Q5JV73 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FRMPD3Q5JV73 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms