Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAVIN4Q5BKX8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAVIN4Q5BKX8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAVIN4Q5BKX8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms