Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL22Q53GT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL22Q53GT1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms