Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
HSD17B12Q53GQ0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms