Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms