Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TPRNQ4KMQ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TPRNQ4KMQ1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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