Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRY2Q49AN0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRY2Q49AN0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms